……upgradeする先のリポジトリくらい確認しませうね

C:\ > ppm upgrade -install
...(略)...
Note: Compress-Zlib version 1.41 is available from more than one place.
Which repository would you like to upgrade from?
1. Autonamed 1
2. tcool
3. Autonamed 2
Repository? [Autonamed 2]

デフォルトで指定されている[Autonamed 2]でそのまま Enter。あとはメッセージの一部を羅列しておきます。適宜解釈してください。私は全部 Enter 押しただけ。

• http://www12.atwiki.jp/0141029/pages/232.html

理由を説明する必要はないと思いますが、せっかくppm upgrade -installしても、ここでよそのリポジトリ（[Autonamed 2]）を選んだら意味ないです。全部のメッセージを読めとは言いませんが、なんでもEnterすりゃいいってものでもないんですよ。